Análises microbiológicas

O envio de espécimes biológicos deve cumprir os protocolos estabelecidos pelo serviço de estafeta ou de transporte utilizado. Em alguns casos, o transporte aéreo exige o cumprimento da regulamentação da Associação Internacional de Transporte Aéreo (IATA) para materiais perigosos.

Qualquer agente infeccioso específico clinicamente suspeito deve ser anotado no formulário de envio; alguns organismos têm requisitos específicos de crescimento (por exemplo, cultura anaeróbia, meios especiais) que podem não ser utilizados rotineiramente nos laboratórios, a menos que o agente patogénico tenha sido citado como diagnóstico diferencial.

As técnicas de laboratório e as capacidades para as análises microbiológicas variam; no entanto, a maioria das análises baseia-se no crescimento ou na visualização de organismos viáveis intactos ou na deteção dos ácidos nucleicos e das proteínas desses agentes patogénicos. Por conseguinte, as amostras não fixadas (tecidos, fluidos, etc.) devem ser recolhidas de forma asséptica e enviadas rapidamente para evitar a sua degradação.

Se existir a possibilidade de realizar uma cultura microbiana de uma amostra de fluido como a urina ou um derrame cavitário, deverá ser enviada uma alíquota separada do fluido num recipiente estéril e sem aditivos. Os tubos que contêm EDTA ou outros conservantes são habitualmente ideais para a avaliação citológica, mas inaceitáveis para a cultura.

Se forem realizados ensaios de PCR, é especialmente importante evitar a contaminação cruzada entre vários animais de um mesmo envio; este princípio aplica-se a tecidos, fluidos e até instrumentos de disseção.

Além disso, as zaragatoas para a análise de PCR não devem ser colocadas em meios de transporte à base de ágar ou carvão, e devem evitar-se as zaragatoas de alginato de cálcio. Em vez disso, devem enviar-se aplicadores estéreis com ponta de algodão ou poliéster num tubo, secos (sem meio de transporte.

Os requisitos para o ensaio de PCR podem variar muito consoante o teste de PCR específico, pelo que se recomenda vivamente consultar o laboratório recetor antes de recolher a amostra.

Alguns protocolos de análise podem permitir a agregação de amostras de órgãos de um indivíduo; no entanto, em geral é preferível que cada tecido seja recolhido em sacos ou tubos estéreis separados e claramente etiquetados para o envio. As amostras de intestino nunca devem ser misturadas num recipiente com outras amostras de tecido.

Os tecidos e fluidos para a maioria dos ensaios microbiológicos podem ser congelados antes do envio, mas a congelação não costuma ser aconselhável se as amostras puderem ser refrigeradas e entregues diretamente no laboratório nas 24 horas seguintes à sua recolha.

As exceções a esta regra incluem a análise de certas toxinas, como as de Clostridium perfringens e C botulinum, nas quais a degradação da toxina deve ser evitada através da congelação imediata após a recolha. Deve ser fornecido um refrigerante adequado para que as amostras permaneçam refrigeradas (ou congeladas) até chegarem ao laboratório.

As amostras fecais para análises parasitológicas devem ser enviadas refrigeradas em recipientes devidamente selados. A congelação pode ter pouco impacto nos testes de rotina de flutuação ou sedimentação, mas anulará a possibilidade da análise de Baermann para larvas de nemátodos. Os ectoparasitas ou nemátodos enviados para identificação deverão ser apresentados em frascos que contenham álcool a 70%.

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