Analisi microbiologiche
L’invio di campioni biologici deve rispettare i protocolli stabiliti dal servizio di corriere o di trasporto utilizzato. In alcuni casi, il trasporto aereo richiede il rispetto della normativa dell’Associazione Internazionale del Trasporto Aereo (IATA) per i materiali pericolosi.
Qualsiasi agente infettivo specifico sospettato clinicamente deve essere annotato sul modulo di invio; alcuni organismi hanno requisiti di crescita specifici (ad esempio, coltura anaerobica, terreni speciali) che possono non essere utilizzati di routine nei laboratori, a meno che il patogeno non sia stato citato come diagnosi differenziale.
Le tecniche di laboratorio e le capacità per i test microbiologici variano; tuttavia, la maggior parte dei test si basa sulla crescita o sulla visualizzazione di organismi vitali intatti o sulla rilevazione degli acidi nucleici e delle proteine di tali patogeni. Pertanto, i campioni non fissati (tessuti, fluidi, ecc.) devono essere prelevati in modo asettico e inviati rapidamente per evitarne il degrado.
Se sussiste la possibilità di eseguire una coltura microbica di un campione di fluido come l’urina o un versamento cavitario, dovrà essere inviata un’aliquota separata del fluido in un contenitore sterile e senza additivi. Le provette contenenti EDTA o altri conservanti sono di solito ideali per la valutazione citologica, ma inaccettabili per la coltura.
Se devono essere eseguiti test PCR, è particolarmente importante evitare la contaminazione crociata tra più animali di uno stesso invio; questo principio si applica ai tessuti, ai fluidi e persino agli strumenti di dissezione.
Inoltre, i tamponi per l’analisi PCR non devono essere collocati in terreni di trasporto a base di agar o carbone, e i tamponi in alginato di calcio devono essere evitati. Al loro posto, si devono inviare applicatori sterili con punta in cotone o poliestere in una provetta, asciutti (senza terreno di trasporto.
I requisiti per il test PCR possono variare molto a seconda del test PCR specifico, pertanto si raccomanda vivamente di consultare il laboratorio ricevente prima di prelevare il campione.
Alcuni protocolli di test possono consentire il raggruppamento di campioni di organi di un singolo individuo; tuttavia, in generale è preferibile che ogni tessuto venga prelevato in sacchetti o provette sterili separati e chiaramente etichettati per l’invio. I campioni di intestino non devono mai essere mescolati in un contenitore con altri campioni di tessuto.
I tessuti e i fluidi per la maggior parte dei test microbiologici possono essere congelati prima dell’invio, ma il congelamento di solito non è consigliabile se i campioni possono essere refrigerati e consegnati direttamente in laboratorio entro le 24 ore dal prelievo.
Le eccezioni a questa regola includono l’analisi di alcune tossine, come quelle di Clostridium perfringens e C botulinum, in cui la degradazione della tossina deve essere evitata mediante congelamento immediato dopo il prelievo. Deve essere fornito un refrigerante adeguato affinché i campioni rimangano refrigerati (o congelati) fino all’arrivo in laboratorio.
I campioni fecali per i test parassitologici devono essere inviati refrigerati in contenitori adeguatamente sigillati. Il congelamento può avere un impatto limitato sui test di routine di flottazione o sedimentazione, ma annullerà la possibilità dell’analisi di Baermann per le larve di nematodi. Gli ectoparassiti o i nematodi inviati per l’identificazione dovranno essere presentati in fiale contenenti alcol al 70%.